Index

A

analyze_run() (in module auto_ncov.core) auto_ncov.config module

auto_ncov.core module auto_ncov.metadata module

C

check_analysis_dependencies_complete() (in module auto_ncov.core)

collect_run_metadata() (in module auto_ncov.metadata) combine_ct_values() (in module auto_ncov.metadata)

F

find_fastq_dirs() (in module auto_ncov.core)

G

get_run_library_ids() (in module auto_ncov.metadata)

L

load_config() (in module auto_ncov.config)

load_metadata() (in module auto_ncov.metadata)

M

module auto_ncov.config auto_ncov.core auto_ncov.metadata

S

scan() (in module auto_ncov.core)

select_run_metadata() (in module auto_ncov.metadata)